PACB公司推出全新Sequel II系统，DNA测序数据输出增加约8倍
2019-04-28 02:40:46 来源：麦姆斯咨询 评论：0 点击：
据麦姆斯咨询报道，基因组、转录组和表观基因组高质量测序供应商美国加州太平洋生物科学公司（Pacific Biosciences of California，PACB）发布商业化Sequel II系统。该系统包括新的SMRT Cell 8M，以及化学、仪器控制软件和SMRT Link软件包。
新系统非常适用于全面的变异检测，大型基因组从头组装，人类结构变异表征，全转录组分析等。
据麦姆斯咨询报道，基因组、转录组和表观基因组高质量测序供应商美国加州太平洋生物科学公司（Pacific Biosciences of California, PACB）发布商业化Sequel® II系统。该系统包括新的SMRT® Cell 8M，以及化学、仪器控制软件和SMRT Link软件包。与之前的Sequel系统相比，最新产品版本进一步降低了项目成本和时间，其数据输出增加了大约8倍。
该公司在5个机构成功实施早期访问计划后，已经开始交付新的商业化仪器，包括维康桑格研究所（Wellcome Sanger Institute）、HudsonAlpha基因组测序中心、马里兰大学基因组科学研究所（University of Maryland Institute for Genome Sciences）、布罗德研究所（Broad Institute）和西奈山伊坎数据科学和基因科技研究所（the Icahn Institute for Data Science and Genomic Technology at Mount Sinai）。所有5个早期访问用户随后都购买了他们的第一款Sequel II系统。
Sequel II系统基于先前版本的成熟技术和工作流程，但是包含更新的硬件以处理新的SMRT Cell 8M。2018年10月发布的版本提供了高精度的个体长读数（高保真读数），Sequel II系统也能够生成这些桑格质量（Sanger-quality）的读数（>99.9%的准确性），且规模为此前版本的8倍。
使用Sequel II系统，客户可以全面检测不同尺寸的人体变异，从单核酸变化到大型、复杂结构的变异。该系统也是标准应用的理想选择，例如大型基因组从头组装和使用Iso-Seq®方法的全转录组分析。对Sequel II数据的广泛分析表明，与Sequel系统相比，该系统可以提供相同或更高的精度。高保真读数可以实现全面的人体变异检测，结构变异查全查准率≥95%，单核苷酸变异查全查准率≥99%，插入和删除查全查准率≥ 96%，且只有15倍的覆盖率。
早期访问用户也通过一系列其他应用评估了该系统。HudsonAlpha生物技术研究所（HudsonAlpha Institute for Biotechnology）的项目成员Jeremy Schmutz评价道，“令人惊讶的是，Sequel II系统所提供的低成本人类基因组测序接近人类参考基因组的质量和完整性，而后者需花费数十亿美元和多年时间才得以生成。我们已经将Sequel II仪器用于人类基因组和复杂的植物基因组，结果至少与我们从原始Sequel系统中获得的数据一样好，并且拥有更高的吞吐量。”
马里兰大学基因组科学研究所基因组学资源中心的科学主管Luke Tallon表示，“根据我们的经验，Sequel II系统基本上拿出来就可以直接应用，我们已将其用于一系列应用和样品类型，从人类基因组测序到宏基因组和微生物组分析，再到非模式植物和动物基因组，最终得出的结果都很好。对于我们这种每年处理数万个微生物样本的实验室而言，Sequel II系统有可能实现真正深入且经济有效的微生物组和宏基因组测序。”
太平洋生物科学公司的首席执行官Michael Hunkapiller博士总结道，“我们对早期访问测试的结果非常满意，这证实了我们对该系统的内部评估。通过大幅提高吞吐量，同时持续提供具有行业准确性的长读数，Sequel II系统已经可以帮助科学家们观察到长期以来难以处理的元素，从而推动科学进步。早期访问期间运行的第一个SMRT细胞是植物基因组，其连续性比当前公布的参考物高10倍。随着越来越多的科学家们访问这一卓越的测序系统，我们期待看到更多首创的结果。”
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